Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN8P56748 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN8P56748 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN8P56748 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN8P56748 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN8P56748 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN8P56748 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN8P56748 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN8P56748 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN8P56748 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN8P56748 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN8P56748 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN8P56748 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN8P56748 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN8P56748 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN8P56748 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN8P56748 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN8P56748 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN8P56748 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN8P56748 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN8P56748 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN8P56748 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN8P56748 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN8P56748 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN8P56748 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN8P56748 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN8P56748 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN8P56748 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN8P56748 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN8P56748 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN8P56748 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN8P56748 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN8P56748 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN8P56748 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN8P56748 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN8P56748 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN8P56748 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN8P56748 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN8P56748 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN8P56748 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN8P56748 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN8P56748 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN8P56748 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN8P56748 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN8P56748 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN8P56748 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN8P56748 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN8P56748 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN8P56748 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN8P56748 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN8P56748 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN8P56748 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN8P56748 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN8P56748 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN8P56748 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN8P56748 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN8P56748 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN8P56748 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN8P56748 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN8P56748 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN8P56748 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN8P56748 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN8P56748 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN8P56748 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN8P56748 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN8P56748 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN8P56748 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLDN8P56748 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLDN8P56748 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLDN8P56748 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms