Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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CLDN15P56746 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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CLDN15P56746 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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CLDN15P56746 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CLDN15P56746 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CLDN15P56746 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CLDN15P56746 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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