Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms