Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP9P55211 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP9P55211 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP9P55211 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP9P55211 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP9P55211 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP9P55211 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP9P55211 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP9P55211 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP9P55211 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP9P55211 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP9P55211 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP9P55211 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP9P55211 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP9P55211 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP9P55211 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP9P55211 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP9P55211 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP9P55211 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP9P55211 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP9P55211 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP9P55211 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP9P55211 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP9P55211 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP9P55211 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP9P55211 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP9P55211 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP9P55211 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP9P55211 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP9P55211 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP9P55211 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP9P55211 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP9P55211 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP9P55211 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP9P55211 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP9P55211 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP9P55211 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP9P55211 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP9P55211 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP9P55211 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP9P55211 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP9P55211 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP9P55211 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP9P55211 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP9P55211 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP9P55211 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP9P55211 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP9P55211 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP9P55211 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP9P55211 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP9P55211 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP9P55211 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP9P55211 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP9P55211 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP9P55211 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP9P55211 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP9P55211 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP9P55211 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP9P55211 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP9P55211 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP9P55211 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP9P55211 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP9P55211 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP9P55211 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP9P55211 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP9P55211 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP9P55211 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP9P55211 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP9P55211 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP9P55211 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP9P55211 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP9P55211 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP9P55211 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP9P55211 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP9P55211 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP9P55211 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP9P55211 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP9P55211 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP9P55211 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP9P55211 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP9P55211 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP9P55211 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP9P55211 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP9P55211 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP9P55211 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP9P55211 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP9P55211 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP9P55211 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP9P55211 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP9P55211 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP9P55211 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP9P55211 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP9P55211 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP9P55211 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP9P55211 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP9P55211 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP9P55211 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP9P55211 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP9P55211 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP9P55211 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms