Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A2P55011 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms