Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA2D1P54289 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms