Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HIRAP54198 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HIRAP54198 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HIRAP54198 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HIRAP54198 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HIRAP54198 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIRAP54198 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIRAP54198 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIRAP54198 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIRAP54198 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIRAP54198 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIRAP54198 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIRAP54198 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIRAP54198 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIRAP54198 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIRAP54198 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIRAP54198 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HIRAP54198 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIRAP54198 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIRAP54198 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HIRAP54198 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIRAP54198 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIRAP54198 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HIRAP54198 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIRAP54198 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIRAP54198 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIRAP54198 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIRAP54198 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIRAP54198 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIRAP54198 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIRAP54198 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HIRAP54198 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIRAP54198 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIRAP54198 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIRAP54198 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIRAP54198 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIRAP54198 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIRAP54198 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIRAP54198 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIRAP54198 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIRAP54198 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIRAP54198 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIRAP54198 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIRAP54198 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIRAP54198 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIRAP54198 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIRAP54198 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIRAP54198 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HIRAP54198 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIRAP54198 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HIRAP54198 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIRAP54198 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HIRAP54198 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIRAP54198 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIRAP54198 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIRAP54198 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIRAP54198 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIRAP54198 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIRAP54198 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIRAP54198 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIRAP54198 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HIRAP54198 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIRAP54198 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIRAP54198 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIRAP54198 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIRAP54198 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIRAP54198 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIRAP54198 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIRAP54198 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIRAP54198 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIRAP54198 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIRAP54198 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIRAP54198 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIRAP54198 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIRAP54198 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIRAP54198 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIRAP54198 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIRAP54198 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIRAP54198 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIRAP54198 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIRAP54198 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIRAP54198 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIRAP54198 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIRAP54198 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIRAP54198 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIRAP54198 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIRAP54198 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIRAP54198 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIRAP54198 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIRAP54198 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIRAP54198 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HIRAP54198 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HIRAP54198 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HIRAP54198 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HIRAP54198 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HIRAP54198 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HIRAP54198 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HIRAP54198 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HIRAP54198 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HIRAP54198 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms