Protein–RNA interactions for Protein: P52788

SMS, Spermine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMSP52788 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMSP52788 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMSP52788 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMSP52788 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMSP52788 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMSP52788 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMSP52788 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMSP52788 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMSP52788 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMSP52788 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMSP52788 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMSP52788 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMSP52788 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMSP52788 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMSP52788 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMSP52788 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMSP52788 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMSP52788 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMSP52788 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMSP52788 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMSP52788 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMSP52788 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMSP52788 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMSP52788 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMSP52788 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMSP52788 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMSP52788 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMSP52788 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMSP52788 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMSP52788 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMSP52788 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMSP52788 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMSP52788 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMSP52788 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMSP52788 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMSP52788 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMSP52788 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMSP52788 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMSP52788 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMSP52788 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMSP52788 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMSP52788 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMSP52788 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMSP52788 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMSP52788 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMSP52788 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMSP52788 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMSP52788 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMSP52788 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMSP52788 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMSP52788 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMSP52788 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMSP52788 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMSP52788 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMSP52788 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMSP52788 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMSP52788 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMSP52788 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMSP52788 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMSP52788 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMSP52788 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMSP52788 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMSP52788 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMSP52788 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMSP52788 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMSP52788 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMSP52788 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMSP52788 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMSP52788 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMSP52788 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMSP52788 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMSP52788 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMSP52788 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMSP52788 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMSP52788 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMSP52788 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMSP52788 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMSP52788 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMSP52788 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMSP52788 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMSP52788 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMSP52788 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMSP52788 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMSP52788 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMSP52788 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMSP52788 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMSP52788 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMSP52788 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMSP52788 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMSP52788 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMSP52788 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMSP52788 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMSP52788 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMSP52788 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMSP52788 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMSP52788 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMSP52788 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMSP52788 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMSP52788 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMSP52788 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms