Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERFP50548 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERFP50548 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERFP50548 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERFP50548 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERFP50548 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERFP50548 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERFP50548 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERFP50548 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERFP50548 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERFP50548 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERFP50548 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERFP50548 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERFP50548 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ERFP50548 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERFP50548 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERFP50548 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERFP50548 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERFP50548 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERFP50548 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERFP50548 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERFP50548 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERFP50548 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERFP50548 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERFP50548 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERFP50548 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERFP50548 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ERFP50548 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERFP50548 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERFP50548 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERFP50548 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERFP50548 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERFP50548 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERFP50548 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERFP50548 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERFP50548 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERFP50548 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERFP50548 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERFP50548 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERFP50548 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERFP50548 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERFP50548 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERFP50548 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERFP50548 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERFP50548 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERFP50548 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERFP50548 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERFP50548 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERFP50548 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERFP50548 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERFP50548 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERFP50548 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERFP50548 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERFP50548 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERFP50548 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERFP50548 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERFP50548 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERFP50548 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERFP50548 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ERFP50548 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERFP50548 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERFP50548 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERFP50548 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERFP50548 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERFP50548 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERFP50548 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERFP50548 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ERFP50548 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERFP50548 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERFP50548 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ERFP50548 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERFP50548 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERFP50548 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERFP50548 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERFP50548 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERFP50548 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERFP50548 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERFP50548 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERFP50548 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERFP50548 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERFP50548 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERFP50548 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERFP50548 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERFP50548 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERFP50548 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERFP50548 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERFP50548 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERFP50548 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERFP50548 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERFP50548 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERFP50548 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERFP50548 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERFP50548 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERFP50548 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERFP50548 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
ERFP50548 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
ERFP50548 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERFP50548 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERFP50548 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERFP50548 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms