Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPD2P43304 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPD2P43304 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPD2P43304 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPD2P43304 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPD2P43304 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPD2P43304 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPD2P43304 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPD2P43304 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPD2P43304 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPD2P43304 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPD2P43304 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPD2P43304 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPD2P43304 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPD2P43304 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPD2P43304 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPD2P43304 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GPD2P43304 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPD2P43304 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPD2P43304 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPD2P43304 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPD2P43304 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPD2P43304 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPD2P43304 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPD2P43304 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPD2P43304 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPD2P43304 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPD2P43304 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPD2P43304 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPD2P43304 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPD2P43304 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPD2P43304 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPD2P43304 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPD2P43304 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPD2P43304 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPD2P43304 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GPD2P43304 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPD2P43304 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPD2P43304 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPD2P43304 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GPD2P43304 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GPD2P43304 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GPD2P43304 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GPD2P43304 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GPD2P43304 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPD2P43304 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPD2P43304 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPD2P43304 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPD2P43304 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPD2P43304 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPD2P43304 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPD2P43304 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPD2P43304 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPD2P43304 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPD2P43304 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPD2P43304 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPD2P43304 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPD2P43304 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPD2P43304 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPD2P43304 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPD2P43304 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPD2P43304 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPD2P43304 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPD2P43304 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPD2P43304 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPD2P43304 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPD2P43304 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPD2P43304 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPD2P43304 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GPD2P43304 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GPD2P43304 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GPD2P43304 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPD2P43304 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPD2P43304 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPD2P43304 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPD2P43304 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPD2P43304 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPD2P43304 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPD2P43304 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPD2P43304 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPD2P43304 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GPD2P43304 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPD2P43304 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPD2P43304 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPD2P43304 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPD2P43304 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPD2P43304 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPD2P43304 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPD2P43304 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPD2P43304 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPD2P43304 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPD2P43304 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPD2P43304 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPD2P43304 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPD2P43304 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPD2P43304 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPD2P43304 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPD2P43304 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPD2P43304 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPD2P43304 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms