Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NUP62P37198 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NUP62P37198 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NUP62P37198 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NUP62P37198 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NUP62P37198 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NUP62P37198 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NUP62P37198 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NUP62P37198 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NUP62P37198 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NUP62P37198 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NUP62P37198 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NUP62P37198 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NUP62P37198 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NUP62P37198 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NUP62P37198 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NUP62P37198 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NUP62P37198 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NUP62P37198 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NUP62P37198 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NUP62P37198 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NUP62P37198 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NUP62P37198 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NUP62P37198 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NUP62P37198 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NUP62P37198 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NUP62P37198 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
NUP62P37198 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NUP62P37198 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NUP62P37198 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
NUP62P37198 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NUP62P37198 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NUP62P37198 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
NUP62P37198 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NUP62P37198 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NUP62P37198 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NUP62P37198 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NUP62P37198 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NUP62P37198 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NUP62P37198 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP62P37198 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP62P37198 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP62P37198 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP62P37198 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP62P37198 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP62P37198 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP62P37198 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP62P37198 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP62P37198 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP62P37198 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP62P37198 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP62P37198 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP62P37198 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP62P37198 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP62P37198 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP62P37198 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP62P37198 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP62P37198 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP62P37198 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP62P37198 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP62P37198 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP62P37198 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP62P37198 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP62P37198 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP62P37198 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP62P37198 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP62P37198 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP62P37198 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP62P37198 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP62P37198 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP62P37198 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP62P37198 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP62P37198 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP62P37198 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP62P37198 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP62P37198 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP62P37198 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP62P37198 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP62P37198 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP62P37198 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP62P37198 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP62P37198 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP62P37198 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP62P37198 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP62P37198 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP62P37198 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP62P37198 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP62P37198 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP62P37198 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP62P37198 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP62P37198 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NUP62P37198 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NUP62P37198 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NUP62P37198 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NUP62P37198 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NUP62P37198 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NUP62P37198 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NUP62P37198 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NUP62P37198 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NUP62P37198 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms