Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LTBRP36941 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LTBRP36941 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LTBRP36941 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LTBRP36941 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LTBRP36941 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LTBRP36941 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LTBRP36941 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LTBRP36941 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LTBRP36941 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LTBRP36941 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LTBRP36941 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LTBRP36941 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LTBRP36941 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LTBRP36941 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LTBRP36941 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LTBRP36941 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LTBRP36941 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LTBRP36941 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LTBRP36941 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LTBRP36941 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LTBRP36941 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LTBRP36941 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LTBRP36941 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LTBRP36941 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LTBRP36941 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LTBRP36941 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LTBRP36941 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LTBRP36941 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LTBRP36941 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LTBRP36941 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LTBRP36941 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LTBRP36941 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LTBRP36941 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LTBRP36941 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LTBRP36941 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LTBRP36941 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LTBRP36941 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LTBRP36941 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LTBRP36941 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LTBRP36941 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LTBRP36941 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LTBRP36941 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LTBRP36941 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LTBRP36941 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LTBRP36941 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LTBRP36941 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LTBRP36941 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LTBRP36941 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LTBRP36941 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
LTBRP36941 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
LTBRP36941 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
LTBRP36941 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LTBRP36941 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LTBRP36941 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LTBRP36941 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LTBRP36941 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LTBRP36941 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LTBRP36941 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LTBRP36941 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LTBRP36941 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LTBRP36941 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LTBRP36941 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LTBRP36941 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LTBRP36941 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LTBRP36941 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LTBRP36941 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LTBRP36941 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LTBRP36941 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LTBRP36941 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LTBRP36941 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LTBRP36941 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LTBRP36941 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LTBRP36941 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LTBRP36941 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LTBRP36941 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LTBRP36941 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LTBRP36941 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LTBRP36941 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LTBRP36941 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LTBRP36941 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LTBRP36941 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LTBRP36941 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LTBRP36941 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LTBRP36941 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LTBRP36941 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LTBRP36941 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LTBRP36941 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LTBRP36941 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LTBRP36941 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LTBRP36941 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LTBRP36941 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LTBRP36941 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LTBRP36941 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LTBRP36941 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LTBRP36941 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LTBRP36941 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LTBRP36941 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LTBRP36941 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LTBRP36941 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms