Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GPC1P35052 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GPC1P35052 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
GPC1P35052 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GPC1P35052 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GPC1P35052 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GPC1P35052 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GPC1P35052 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GPC1P35052 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GPC1P35052 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GPC1P35052 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GPC1P35052 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GPC1P35052 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GPC1P35052 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GPC1P35052 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GPC1P35052 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GPC1P35052 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GPC1P35052 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GPC1P35052 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPC1P35052 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPC1P35052 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPC1P35052 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPC1P35052 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPC1P35052 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPC1P35052 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPC1P35052 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPC1P35052 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPC1P35052 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPC1P35052 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPC1P35052 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPC1P35052 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPC1P35052 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPC1P35052 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPC1P35052 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPC1P35052 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPC1P35052 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GPC1P35052 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPC1P35052 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPC1P35052 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPC1P35052 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GPC1P35052 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPC1P35052 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPC1P35052 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPC1P35052 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPC1P35052 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPC1P35052 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPC1P35052 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPC1P35052 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPC1P35052 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPC1P35052 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPC1P35052 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPC1P35052 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPC1P35052 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPC1P35052 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPC1P35052 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPC1P35052 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPC1P35052 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPC1P35052 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPC1P35052 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPC1P35052 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPC1P35052 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPC1P35052 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPC1P35052 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPC1P35052 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPC1P35052 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPC1P35052 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPC1P35052 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC1P35052 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC1P35052 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC1P35052 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC1P35052 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC1P35052 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC1P35052 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC1P35052 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC1P35052 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC1P35052 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC1P35052 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC1P35052 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC1P35052 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC1P35052 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC1P35052 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC1P35052 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC1P35052 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC1P35052 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC1P35052 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC1P35052 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC1P35052 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC1P35052 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC1P35052 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC1P35052 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC1P35052 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC1P35052 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC1P35052 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC1P35052 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC1P35052 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC1P35052 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC1P35052 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC1P35052 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC1P35052 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC1P35052 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms