Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJB2P29033 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJB2P29033 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJB2P29033 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJB2P29033 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJB2P29033 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJB2P29033 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJB2P29033 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJB2P29033 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJB2P29033 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJB2P29033 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJB2P29033 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJB2P29033 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJB2P29033 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJB2P29033 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJB2P29033 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJB2P29033 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJB2P29033 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GJB2P29033 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJB2P29033 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJB2P29033 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GJB2P29033 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GJB2P29033 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJB2P29033 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJB2P29033 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJB2P29033 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GJB2P29033 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJB2P29033 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJB2P29033 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJB2P29033 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJB2P29033 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJB2P29033 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GJB2P29033 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GJB2P29033 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJB2P29033 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GJB2P29033 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJB2P29033 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJB2P29033 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJB2P29033 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJB2P29033 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJB2P29033 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJB2P29033 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJB2P29033 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJB2P29033 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GJB2P29033 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJB2P29033 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJB2P29033 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJB2P29033 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJB2P29033 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJB2P29033 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GJB2P29033 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GJB2P29033 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJB2P29033 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJB2P29033 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJB2P29033 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJB2P29033 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJB2P29033 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJB2P29033 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJB2P29033 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJB2P29033 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJB2P29033 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJB2P29033 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJB2P29033 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJB2P29033 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJB2P29033 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJB2P29033 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJB2P29033 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJB2P29033 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJB2P29033 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJB2P29033 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJB2P29033 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJB2P29033 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJB2P29033 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJB2P29033 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJB2P29033 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJB2P29033 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJB2P29033 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJB2P29033 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJB2P29033 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJB2P29033 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJB2P29033 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJB2P29033 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJB2P29033 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJB2P29033 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GJB2P29033 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJB2P29033 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJB2P29033 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJB2P29033 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJB2P29033 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJB2P29033 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJB2P29033 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJB2P29033 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJB2P29033 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJB2P29033 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJB2P29033 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJB2P29033 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJB2P29033 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJB2P29033 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GJB2P29033 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJB2P29033 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms