Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB9P28065 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms