Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNMT1P26358 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNMT1P26358 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.2 ms