Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms