Protein–RNA interactions for Protein: P21953

BCKDHB, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, humanhuman

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHBP21953 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCKDHBP21953 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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