Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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PTPRAP18433 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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PTPRAP18433 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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PTPRAP18433 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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PTPRAP18433 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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PTPRAP18433 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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PTPRAP18433 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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PTPRAP18433 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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PTPRAP18433 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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