Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
EGR1P18146 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
EGR1P18146 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
EGR1P18146 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
EGR1P18146 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
EGR1P18146 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
EGR1P18146 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
EGR1P18146 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
EGR1P18146 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
EGR1P18146 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
EGR1P18146 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
EGR1P18146 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
EGR1P18146 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
EGR1P18146 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
EGR1P18146 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
EGR1P18146 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
EGR1P18146 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
EGR1P18146 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
EGR1P18146 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
EGR1P18146 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EGR1P18146 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EGR1P18146 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EGR1P18146 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EGR1P18146 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EGR1P18146 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EGR1P18146 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EGR1P18146 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
EGR1P18146 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EGR1P18146 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EGR1P18146 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EGR1P18146 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EGR1P18146 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EGR1P18146 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EGR1P18146 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EGR1P18146 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EGR1P18146 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EGR1P18146 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EGR1P18146 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EGR1P18146 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EGR1P18146 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EGR1P18146 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EGR1P18146 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EGR1P18146 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EGR1P18146 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EGR1P18146 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EGR1P18146 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EGR1P18146 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EGR1P18146 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EGR1P18146 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EGR1P18146 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EGR1P18146 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
EGR1P18146 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EGR1P18146 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EGR1P18146 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EGR1P18146 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EGR1P18146 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EGR1P18146 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EGR1P18146 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EGR1P18146 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EGR1P18146 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EGR1P18146 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
EGR1P18146 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EGR1P18146 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EGR1P18146 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EGR1P18146 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EGR1P18146 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EGR1P18146 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EGR1P18146 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EGR1P18146 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EGR1P18146 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EGR1P18146 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
EGR1P18146 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
EGR1P18146 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
EGR1P18146 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
EGR1P18146 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
EGR1P18146 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
EGR1P18146 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
EGR1P18146 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
EGR1P18146 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
EGR1P18146 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
EGR1P18146 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
EGR1P18146 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
EGR1P18146 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
EGR1P18146 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
EGR1P18146 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
EGR1P18146 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
EGR1P18146 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
EGR1P18146 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
EGR1P18146 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
EGR1P18146 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
EGR1P18146 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
EGR1P18146 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
EGR1P18146 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
EGR1P18146 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
EGR1P18146 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
EGR1P18146 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
EGR1P18146 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
EGR1P18146 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
EGR1P18146 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
EGR1P18146 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms