Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-EP13747 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms