Protein–RNA interactions for Protein: P11362

FGFR1, Fibroblast growth factor receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR1P11362 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FGFR1P11362 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms