Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNB1P11230 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms