Protein–RNA interactions for Protein: P0DJR0

GIMD1, GTPase IMAP family member GIMD1, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIMD1P0DJR0 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIMD1P0DJR0 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GIMD1P0DJR0 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIMD1P0DJR0 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIMD1P0DJR0 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GIMD1P0DJR0 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GIMD1P0DJR0 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIMD1P0DJR0 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIMD1P0DJR0 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIMD1P0DJR0 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIMD1P0DJR0 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIMD1P0DJR0 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIMD1P0DJR0 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GIMD1P0DJR0 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIMD1P0DJR0 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIMD1P0DJR0 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIMD1P0DJR0 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
GIMD1P0DJR0 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
GIMD1P0DJR0 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIMD1P0DJR0 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms