Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ87

DUX4L4, Double homeobox protein 4-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L4P0CJ87 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX4L4P0CJ87 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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