Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms