Protein–RNA interactions for Protein: P04114

APOB, Apolipoprotein B-100, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBP04114 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
APOBP04114 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
APOBP04114 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC10□□□□□ -0.81
APOBP04114 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
APOBP04114 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
APOBP04114 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
APOBP04114 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
APOBP04114 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
APOBP04114 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
APOBP04114 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
APOBP04114 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
APOBP04114 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
APOBP04114 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC10□□□□□ -0.81
APOBP04114 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
APOBP04114 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
APOBP04114 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC10□□□□□ -0.81
APOBP04114 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
APOBP04114 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
APOBP04114 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
APOBP04114 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
APOBP04114 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
APOBP04114 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
APOBP04114 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
APOBP04114 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
APOBP04114 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
APOBP04114 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
APOBP04114 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
APOBP04114 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
APOBP04114 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC10□□□□□ -0.81
APOBP04114 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
APOBP04114 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
APOBP04114 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
APOBP04114 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC10□□□□□ -0.81
APOBP04114 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
APOBP04114 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
APOBP04114 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
APOBP04114 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
APOBP04114 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
APOBP04114 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
APOBP04114 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
APOBP04114 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
APOBP04114 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
APOBP04114 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
APOBP04114 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
APOBP04114 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
APOBP04114 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
APOBP04114 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
APOBP04114 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
APOBP04114 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
APOBP04114 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
APOBP04114 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
APOBP04114 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
APOBP04114 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
APOBP04114 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
APOBP04114 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
APOBP04114 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
APOBP04114 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
APOBP04114 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
APOBP04114 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
APOBP04114 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
APOBP04114 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
APOBP04114 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
APOBP04114 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
APOBP04114 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
APOBP04114 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
APOBP04114 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
APOBP04114 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
APOBP04114 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
APOBP04114 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
APOBP04114 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
APOBP04114 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
APOBP04114 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
APOBP04114 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
APOBP04114 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
APOBP04114 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
APOBP04114 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
APOBP04114 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
APOBP04114 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
APOBP04114 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
APOBP04114 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
APOBP04114 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
APOBP04114 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
APOBP04114 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
APOBP04114 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
APOBP04114 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
APOBP04114 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
APOBP04114 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
APOBP04114 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
APOBP04114 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
APOBP04114 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
APOBP04114 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
APOBP04114 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
APOBP04114 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
APOBP04114 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
APOBP04114 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
APOBP04114 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
APOBP04114 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
APOBP04114 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
APOBP04114 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
APOBP04114 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms