Protein–RNA interactions for Protein: P01008

SERPINC1, Antithrombin-III, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINC1P01008 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms