Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPHP4O75161 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NPHP4O75161 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NPHP4O75161 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms