Protein–RNA interactions for Protein: O60235

TMPRSS11D, Transmembrane protease serine 11D, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11DO60235 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS11DO60235 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms