Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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MTSS1O43312 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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MTSS1O43312 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MTSS1O43312 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
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