Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBDO15205 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBDO15205 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBDO15205 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBDO15205 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBDO15205 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBDO15205 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBDO15205 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBDO15205 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBDO15205 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBDO15205 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBDO15205 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBDO15205 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBDO15205 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBDO15205 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBDO15205 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBDO15205 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBDO15205 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBDO15205 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBDO15205 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBDO15205 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBDO15205 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBDO15205 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBDO15205 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBDO15205 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBDO15205 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBDO15205 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBDO15205 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBDO15205 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBDO15205 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBDO15205 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBDO15205 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBDO15205 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBDO15205 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBDO15205 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBDO15205 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBDO15205 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBDO15205 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBDO15205 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBDO15205 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
UBDO15205 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBDO15205 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBDO15205 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBDO15205 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBDO15205 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBDO15205 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBDO15205 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBDO15205 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBDO15205 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBDO15205 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBDO15205 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBDO15205 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBDO15205 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBDO15205 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBDO15205 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBDO15205 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBDO15205 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBDO15205 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBDO15205 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBDO15205 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
UBDO15205 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBDO15205 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBDO15205 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBDO15205 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBDO15205 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBDO15205 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBDO15205 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBDO15205 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBDO15205 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBDO15205 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBDO15205 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBDO15205 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBDO15205 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBDO15205 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBDO15205 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBDO15205 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBDO15205 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBDO15205 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBDO15205 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBDO15205 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBDO15205 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBDO15205 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBDO15205 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBDO15205 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBDO15205 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBDO15205 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBDO15205 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBDO15205 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBDO15205 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBDO15205 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBDO15205 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBDO15205 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBDO15205 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UBDO15205 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBDO15205 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBDO15205 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBDO15205 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBDO15205 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBDO15205 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBDO15205 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms