Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNMO15061 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNMO15061 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNMO15061 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNMO15061 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNMO15061 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNMO15061 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNMO15061 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNMO15061 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNMO15061 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNMO15061 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNMO15061 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNMO15061 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNMO15061 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNMO15061 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNMO15061 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNMO15061 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNMO15061 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNMO15061 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNMO15061 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNMO15061 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNMO15061 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNMO15061 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNMO15061 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNMO15061 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNMO15061 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNMO15061 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNMO15061 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNMO15061 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNMO15061 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNMO15061 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNMO15061 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNMO15061 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNMO15061 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNMO15061 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNMO15061 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNMO15061 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNMO15061 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNMO15061 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNMO15061 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNMO15061 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNMO15061 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNMO15061 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNMO15061 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNMO15061 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNMO15061 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNMO15061 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNMO15061 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SYNMO15061 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SYNMO15061 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNMO15061 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNMO15061 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNMO15061 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNMO15061 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNMO15061 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNMO15061 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNMO15061 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNMO15061 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNMO15061 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNMO15061 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNMO15061 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNMO15061 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNMO15061 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNMO15061 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNMO15061 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNMO15061 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNMO15061 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNMO15061 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNMO15061 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNMO15061 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNMO15061 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNMO15061 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNMO15061 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNMO15061 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNMO15061 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNMO15061 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNMO15061 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNMO15061 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNMO15061 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNMO15061 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNMO15061 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNMO15061 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNMO15061 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNMO15061 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNMO15061 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNMO15061 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNMO15061 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNMO15061 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNMO15061 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNMO15061 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNMO15061 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNMO15061 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNMO15061 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNMO15061 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNMO15061 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNMO15061 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNMO15061 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNMO15061 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNMO15061 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNMO15061 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms