Protein–RNA interactions for Protein: O15020

SPTBN2, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN2O15020 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTBN2O15020 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms