Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3AO14802 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3AO14802 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3AO14802 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3AO14802 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3AO14802 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3AO14802 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3AO14802 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3AO14802 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3AO14802 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3AO14802 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3AO14802 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3AO14802 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3AO14802 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3AO14802 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3AO14802 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3AO14802 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3AO14802 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3AO14802 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3AO14802 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3AO14802 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3AO14802 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3AO14802 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3AO14802 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3AO14802 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3AO14802 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3AO14802 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3AO14802 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3AO14802 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3AO14802 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3AO14802 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3AO14802 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3AO14802 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3AO14802 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3AO14802 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3AO14802 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3AO14802 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3AO14802 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3AO14802 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3AO14802 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3AO14802 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3AO14802 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3AO14802 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3AO14802 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3AO14802 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3AO14802 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3AO14802 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3AO14802 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3AO14802 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3AO14802 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3AO14802 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3AO14802 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3AO14802 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3AO14802 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3AO14802 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3AO14802 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3AO14802 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3AO14802 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3AO14802 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3AO14802 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3AO14802 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3AO14802 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3AO14802 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3AO14802 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3AO14802 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3AO14802 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
POLR3AO14802 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3AO14802 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3AO14802 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3AO14802 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3AO14802 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3AO14802 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3AO14802 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3AO14802 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3AO14802 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3AO14802 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3AO14802 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3AO14802 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3AO14802 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3AO14802 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3AO14802 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3AO14802 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3AO14802 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3AO14802 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3AO14802 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3AO14802 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3AO14802 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3AO14802 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3AO14802 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3AO14802 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3AO14802 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3AO14802 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3AO14802 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3AO14802 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3AO14802 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3AO14802 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3AO14802 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3AO14802 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3AO14802 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3AO14802 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms