Protein–RNA interactions for Protein: O14529

CUX2, Homeobox protein cut-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX2O14529 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CUX2O14529 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CUX2O14529 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CUX2O14529 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CUX2O14529 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CUX2O14529 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CUX2O14529 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CUX2O14529 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CUX2O14529 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CUX2O14529 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CUX2O14529 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CUX2O14529 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CUX2O14529 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CUX2O14529 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CUX2O14529 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CUX2O14529 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CUX2O14529 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CUX2O14529 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CUX2O14529 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CUX2O14529 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CUX2O14529 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CUX2O14529 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CUX2O14529 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CUX2O14529 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CUX2O14529 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CUX2O14529 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CUX2O14529 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CUX2O14529 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CUX2O14529 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CUX2O14529 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CUX2O14529 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CUX2O14529 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CUX2O14529 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CUX2O14529 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CUX2O14529 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CUX2O14529 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CUX2O14529 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CUX2O14529 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CUX2O14529 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CUX2O14529 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CUX2O14529 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CUX2O14529 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CUX2O14529 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CUX2O14529 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CUX2O14529 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CUX2O14529 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CUX2O14529 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CUX2O14529 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CUX2O14529 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CUX2O14529 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CUX2O14529 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CUX2O14529 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CUX2O14529 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CUX2O14529 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CUX2O14529 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CUX2O14529 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CUX2O14529 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CUX2O14529 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CUX2O14529 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CUX2O14529 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CUX2O14529 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CUX2O14529 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CUX2O14529 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CUX2O14529 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CUX2O14529 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CUX2O14529 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CUX2O14529 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CUX2O14529 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CUX2O14529 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CUX2O14529 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CUX2O14529 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CUX2O14529 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CUX2O14529 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CUX2O14529 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CUX2O14529 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CUX2O14529 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CUX2O14529 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CUX2O14529 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CUX2O14529 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CUX2O14529 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CUX2O14529 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CUX2O14529 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CUX2O14529 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CUX2O14529 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CUX2O14529 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CUX2O14529 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CUX2O14529 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CUX2O14529 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
CUX2O14529 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CUX2O14529 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CUX2O14529 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CUX2O14529 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CUX2O14529 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CUX2O14529 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CUX2O14529 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CUX2O14529 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CUX2O14529 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CUX2O14529 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CUX2O14529 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CUX2O14529 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms