Protein–RNA interactions for Protein: O00253

AGRP, Agouti-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRPO00253 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGRPO00253 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGRPO00253 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGRPO00253 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGRPO00253 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGRPO00253 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGRPO00253 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AGRPO00253 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGRPO00253 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGRPO00253 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGRPO00253 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGRPO00253 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGRPO00253 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGRPO00253 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGRPO00253 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGRPO00253 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGRPO00253 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGRPO00253 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AGRPO00253 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AGRPO00253 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGRPO00253 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AGRPO00253 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGRPO00253 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AGRPO00253 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AGRPO00253 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGRPO00253 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGRPO00253 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGRPO00253 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGRPO00253 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGRPO00253 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGRPO00253 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGRPO00253 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGRPO00253 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGRPO00253 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGRPO00253 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AGRPO00253 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGRPO00253 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGRPO00253 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGRPO00253 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGRPO00253 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGRPO00253 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AGRPO00253 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGRPO00253 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGRPO00253 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGRPO00253 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGRPO00253 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGRPO00253 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGRPO00253 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGRPO00253 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGRPO00253 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGRPO00253 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGRPO00253 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGRPO00253 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGRPO00253 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGRPO00253 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGRPO00253 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGRPO00253 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGRPO00253 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGRPO00253 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGRPO00253 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGRPO00253 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGRPO00253 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGRPO00253 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGRPO00253 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGRPO00253 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGRPO00253 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGRPO00253 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AGRPO00253 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AGRPO00253 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGRPO00253 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGRPO00253 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AGRPO00253 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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AGRPO00253 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AGRPO00253 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AGRPO00253 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGRPO00253 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGRPO00253 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGRPO00253 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGRPO00253 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGRPO00253 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGRPO00253 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGRPO00253 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGRPO00253 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGRPO00253 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGRPO00253 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGRPO00253 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGRPO00253 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AGRPO00253 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AGRPO00253 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGRPO00253 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGRPO00253 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGRPO00253 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGRPO00253 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGRPO00253 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGRPO00253 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGRPO00253 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGRPO00253 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGRPO00253 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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