Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms