Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf172C9J069 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms