Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SERINC4A6NH21 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms