Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
STRCP1A6NGW2 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRCP1A6NGW2 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms