Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms