Protein–RNA interactions for Protein: A1X283

SH3PXD2B, SH3 and PX domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3PXD2BA1X283 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3PXD2BA1X283 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms