Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM35Q9UPQ4 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms