Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL8

PHF11, PHD finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF11Q9UIL8 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF11Q9UIL8 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms