Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms