Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CHRNA9Q9UGM1 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CHRNA9Q9UGM1 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHRNA9Q9UGM1 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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