Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKX1-2Q9UD57 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms