Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2F8

SIPA1L2, Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1L2Q9P2F8 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIPA1L2Q9P2F8 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms