Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms